حقوق اعضای هیات علمی دانشگاه ها با رعایت ماده ۵ قانون اصلاح پاره ای از مقررات مربوط به اعضای هیات علمی آموزشی و پژوهشی شاغل و بازنشسته دانشگاه ها و موسسات آموزشی عالی مصوب 1368/12/16 با اصلاحات و الحاقات بعدی با رعایت معافیت های مقرر در قانون مالیات‌های مستقیم در سال ۱۳۹۸ مشمول مالیات به نرخ ۱۰ درصد خواهد بود.

بر اساس ماده ۵ قانون اصلاح پاره ای از مقررات مربوط به پایه حقوقی اعضای رسمی هیئت علمی آموزشی و پرورشی شاغل و بازنشسته دانشگاه‌ها و موسسات آموزش عالی از درآمد مشمول مالیات تا حقوق اعضای هیئت علمی موضوع این قانون با رعایت معافیت های مقرر در قانون مالیات‌های مستقیم و حداکثر ۱۰ درصد به عنوان مالیات کسر می شود.
با توجه به اینکه در بند الف تبصره مذکور عبارت کارانه خارج از موارد استثنا شده مربوط به حقوق اعضای هیئت علمی به کار رفته است بنابراین کارانه دریافتی توسط اعضای هیئت علمی مشغول نرخ ۱۰ درصد نبوده و با توجه به میزانی که حقوق و مزایای اعضای هیئت علمی دانشگاه‌ها نرخ پلکانی مقر را پوشش می‌دهد به نرخ های بعدی مشمول مالیات خواهد بود.

به عنوان مثال: چنانچه حقوق و مزایای فوق العاده اعضای هیات علمی مبلغ ریال باشد کارانه دریافتی به نرخ‌های مربوط به درآمد مازاد بر مبلغ یادشده حسن مورد ۲۰ درصد ۲۵ درصد و ۳۵ درصد مشمول مالیات خواهد بود.

خاطرنشان می شود معافیت حقوق موضوع ماده ۸۴ قانون مالیاتهای مستقیم ابتدا حقوق و مزایای فوق العاده اعضای هیئت علمی اعمال می شود در صورتی که معافیت مذکور مازاد بر حقوق و مزایای فوق العاده باشد مازاد معافیت مذکور قابل اعمال به کارانه دریافتی اعضای هیئت علمی نیز خواهد بود.